Хоринский район (аймак) был образован 23 ноября 1923 года в числе первых административных единиц Бурят-Монгольской АССР. В этот день состоялся I съезд Советов рабочих, красноармейских, крестьянских депутатов с участием М.Н. Ербанова.
В то время территория района простиралась от Верхнеудинска (Улан-Удэ) на западе до Читы на востоке, включая Кижингинский, Еравнинский, Хоринский, Заиграевский и часть Мухоршибирского районов. Вскоре земли нынешних Еравнинского и Заиграевского районов были выделены в самостоятельные аймаки, а часть южных земель отошла к Мухоршибирскому району. В декабре 1940 года из состава Хоринского района вышел Кижингинский район.
Значительная часть населенных пунктов района была основана в прошлом и позапрошлом веках местным населением, переходившим на оседлый образ жизни, и переселенцами-старообрядцами. В нашем веке на карте района появились такие крупные населенные пункты, как Хандагай, Нарын, Малая Курба, Нижняя Майла, Зун-Хурай и другие.
О древней истории края свидетельствуют памятники археологии. Интересны 3 разновременных археологических памятника: стоянка древнего человека Хотык – 3, палеолитическая стоянка 40 тысячелетней давности Ирэн–Хада, наскальные рисунки эпохи бронзы, раннего железа Аланские петроглифы. Многочисленные неолитические стоянки, поселения возле сел Хоринск, Малая Курба, Булуганск, Ашанга, Георгиевка, множество плиточных могил, писаницы на скале «Наран-Хухэ шулуунай хунды» на горе Наран–Хабсагай в Алане, писаницы на берегу реки Шубугуй в 15 км. от с. Улан–Одон. Самым интересным памятником является поселение Санный мыс, где было найдено уникальное жилище древних людей.
В районе 22 памятника истории. Среди них Анинский дацан, который является архитектурным памятником. Дацан, построенный в 1808г., представлял собой двухэтажный кирпичный корпус, главный дуган, квадратную каменную ограду, субурганы. Впоследствии дацан еще не раз подвергался изменениям. К 1870г. Анинский дацан представлял целый архитектурный комплекс. В него входили 5 больших дуганов: Хурдуйн-сумме, Дэнчок-сумэ-оточи, Сумэ Аюши и Сумэ Майдари. Ныне действующий дацан находится близ села Алан. В настоящее время восстанавливаются святые места, храмы, субурганы. Так, 19 декабря 1993г. в день Святого Николая чудотворца (в честь которого названа церковь) состоялось возрождение Свято-Никольской церкви.